Dezinfekcija vode ima za cilj da uništi ili inaktiviše patogene i fakultativno patogene mikroorganizme.  Pored vode za piće, i tehnološke vode moraju biti bakteriološki besprekorne u mnogim tehnološkim procesima, a pogotovo se ovo odnosi na prehrambenu  industriju.  Dezinfekciji se podvrgava voda koja je već prošla sve potrebne faze prečišćavanja jer  bi u suprotnom, lebdeće materije mogle zaštiti bakterije od delovanja dezinfekcionog sredstva.  U pojedinim slučajevima, dezinfekcija vode se vrši kao samostalna mera, uglavnom kod površinskih i podzemnih voda nepouzdanih u pogledu bakteriološke ispravnosti.

      Najčešće primenjivani procesi dezinfekcije vode su:

• hlorisanje vode,
• UV sterilizacija,
  
• mikrobiološka filtracija.